Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXTL3O43909 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms