Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms