Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNAB3O43448 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 344.7 ms