Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOCS1O15524 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms