Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAD51BO15315 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51BO15315 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms