Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB6O15197 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB6O15197 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms