Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A2O14975 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms