Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1I1O14576 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1I1O14576 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1I1O14576 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1I1O14576 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1I1O14576 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1I1O14576 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1I1O14576 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms