Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARVCFO00192 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms