Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP23O00161 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms