Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
J3QQQ9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
J3QQQ9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QQQ9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QQQ9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QQQ9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QQQ9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QQQ9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QQQ9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QQQ9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QQQ9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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