Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QKU1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QKU1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QKU1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QKU1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QKU1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QKU1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QKU1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QKU1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QKU1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QKU1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QKU1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QKU1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QKU1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QKU1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QKU1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QKU1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QKU1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QKU1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QKU1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QKU1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QKU1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QKU1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QKU1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QKU1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QKU1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3QKU1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3QKU1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QKU1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3QKU1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3QKU1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3QKU1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
J3QKU1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3QKU1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
J3QKU1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3QKU1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3QKU1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3QKU1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
J3QKU1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3QKU1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3QKU1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3QKU1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3QKU1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3QKU1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3QKU1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3QKU1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3QKU1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3QKU1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QKU1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QKU1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QKU1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QKU1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QKU1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QKU1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QKU1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QKU1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QKU1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QKU1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QKU1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QKU1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QKU1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QKU1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QKU1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QKU1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QKU1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QKU1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QKU1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QKU1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QKU1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QKU1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QKU1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QKU1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QKU1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms