Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3KT08 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3KT08 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3KT08 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3KT08 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3KT08 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3KT08 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3KT08 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3KT08 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3KT08 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3KT08 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3KT08 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3KT08 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3KT08 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3KT08 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3KT08 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3KT08 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3KT08 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3KT08 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms