Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
I3L3M4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
I3L3M4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
I3L3M4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
I3L3M4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
I3L3M4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
I3L3M4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
I3L3M4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
I3L3M4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
I3L3M4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
I3L3M4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
I3L3M4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
I3L3M4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
I3L3M4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
I3L3M4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
I3L3M4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
I3L3M4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
I3L3M4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
I3L3M4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms