Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0C1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0C1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0C1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0C1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C0C1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C0C1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C0C1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C0C1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C0C1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C0C1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C0C1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C0C1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms