Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms