Protein–RNA interactions for Protein: A8MPP1

DDX11L8, Putative ATP-dependent RNA helicase DDX11-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11L8A8MPP1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11L8A8MPP1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX11L8A8MPP1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms