Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CBY3A6NI87 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms