Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms