Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf51A6NDU8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms