Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms