Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms