Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L4A6NCW7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms