Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POTEFA5A3E0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POTEFA5A3E0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms