Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms