Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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