Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 SEC61A1-203ENST00000464451 1871 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 DUOXA1-208ENST00000558996 2684 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 COL11A1-202ENST00000358392 7327 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 APOBEC3F-202ENST00000381565 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 DLEU1-208ENST00000468168 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 ASS1P10-201ENST00000507235 1244 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 MIR4713HG-201ENST00000559909 561 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 RAB11A-204ENST00000565075 711 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 PIGBOS1-203ENST00000567948 801 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 CA5AP1-201ENST00000568175 576 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 TRAPPC2L-214ENST00000568583 801 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 APOC1P1-204ENST00000575148 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 RN7SL451P-201ENST00000583026 299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 AC008555.5-202ENST00000604749 570 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 AL121845.4-201ENST00000613401 306 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 FAM25BP-201ENST00000623997 268 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 TNNT3-217ENST00000641225 877 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 RD3-201ENST00000367002 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 UPP2-204ENST00000605860 2435 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 SMS-202ENST00000404933 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 ZSCAN30-202ENST00000420878 4323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 TSEN2-204ENST00000415684 2279 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 SPATA22-203ENST00000397168 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 APTX-215ENST00000468275 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 APLF-201ENST00000303795 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 SCN1B-208ENST00000640135 4846 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 ZNF792-202ENST00000605484 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 MKRN7P-202ENST00000640520 1765 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04436 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 TMEM81-201ENST00000367167 1332 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 POLR3C-201ENST00000334163 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 TAF1C-203ENST00000541676 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 SH3GLB1-201ENST00000370558 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 C1RL-AS1-205ENST00000541775 5272 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 PASK-215ENST00000544142 4724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 ARHGEF15-201ENST00000361926 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 AKAP9-216ENST00000619023 6006 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 PTGFR-201ENST00000370756 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 LIN28A-201ENST00000254231 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 LRRC18-201ENST00000374160 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 AP000533.2-201ENST00000417863 2260 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 ARHGAP27-212ENST00000532038 3694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 NVL-201ENST00000281701 3123 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 AC093330.2-201ENST00000624814 3998 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 GPALPP1-202ENST00000361121 3410 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 CADM3-AS1-201ENST00000415675 5044 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 TCERG1-202ENST00000394421 3633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 RARRES3-202ENST00000354445 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 LYZL2-201ENST00000375318 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 NAALAD2-202ENST00000375944 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 NMS-201ENST00000376865 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 MOG-219ENST00000376898 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 KRTAP10-6-201ENST00000400368 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 VSNL1-202ENST00000404666 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 LINC01518-201ENST00000411439 519 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 PPP3CB-AS1-201ENST00000422977 930 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 GRTP1-AS1-202ENST00000423246 465 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 LINC00454-201ENST00000425483 503 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 AL022315.1-201ENST00000428838 498 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 LINC00158-203ENST00000440205 740 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 CHCHD3P3-201ENST00000446783 640 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 PHBP5-201ENST00000449310 768 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 SLA-206ENST00000517648 896 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 AC021678.2-201ENST00000521731 887 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 AC008446.1-201ENST00000522454 451 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 AL049836.1-201ENST00000553270 539 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 PPP2R5C-224ENST00000556946 735 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 AC099524.1-205ENST00000562180 674 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 AC087190.3-201ENST00000562893 753 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 AC106736.1-201ENST00000567721 434 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 AC010761.4-201ENST00000577325 521 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 TSPAN16-204ENST00000590327 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 AC022966.1-201ENST00000591685 593 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04436 AC002401.4-201ENST00000612365 583 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms