Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 ATF2-208ENST00000413123 681 ntTSL 511.19□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 ATF2-216ENST00000435231 784 ntTSL 511.06□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 ATF2-218ENST00000445349 483 ntTSL 410.02□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 ATF2-219ENST00000456655 1861 ntTSL 1 (best)9.68□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 ATF2-206ENST00000409635 2109 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 ATF2-209ENST00000415955 1896 ntTSL 1 (best)8.84□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 ATF2-213ENST00000428760 1989 ntTSL 1 (best)8.22□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 ATF2-211ENST00000421438 1966 ntTSL 1 (best)7.98□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 ATF2-214ENST00000429579 2081 ntTSL 1 (best)7.7□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 ATF2-217ENST00000437522 883 ntTSL 57.52□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 SPAG5-216ENST00000584206 715 ntTSL 47.21□□□□□ -1.263e-11■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.64□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 EIF4G2-220ENST00000531647 579 ntTSL 413.73□□□□□ -0.211e-9■■■■■ 29.4
SF3B1O75533 SRRT-204ENST00000448764 1607 ntTSL 517.88■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 29.3
SF3B1O75533 E4F1-202ENST00000562589 817 ntTSL 527.39■■□□□ 1.971e-8■■■■■ 29.3
SF3B1O75533 E4F1-207ENST00000565413 940 ntTSL 321.88■■□□□ 1.091e-8■■■■■ 29.3
SF3B1O75533 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 29.3
SF3B1O75533 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 29.3
SF3B1O75533 ZNF451-211ENST00000504603 561 ntTSL 53.93□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 29.3
SF3B1O75533 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 29.3
SF3B1O75533 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.795e-7■■■■■ 29.3
SF3B1O75533 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 29.3
SF3B1O75533 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 29.3
SF3B1O75533 NAP1L4-208ENST00000483643 690 ntTSL 26.47□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 MBNL1-207ENST00000459747 594 ntTSL 416.77■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-234ENST00000492871 1065 ntTSL 328.33■■■□□ 2.132e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-215ENST00000462807 628 ntTSL 228.19■■■□□ 2.12e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-227ENST00000485083 871 ntTSL 327.52■■■□□ 22e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-235ENST00000493138 694 ntTSL 327.52■■■□□ 22e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.842e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-213ENST00000453943 656 ntTSL 1 (best)23.19■■□□□ 1.32e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-236ENST00000493209 735 ntTSL 521.25■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-230ENST00000485838 774 ntTSL 320.14■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-214ENST00000460224 639 ntTSL 517.06■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-238ENST00000498092 865 ntTSL 516.69■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-211ENST00000412265 1012 ntTSL 514.65□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 314.61□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-229ENST00000485733 345 ntTSL 313.68□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 GUK1-212ENST00000435153 865 ntTSL 313.61□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 DDX5-213ENST00000579996 820 ntTSL 29.99□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 DDX5-212ENST00000579461 814 ntTSL 35.91□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 MKNK2-203ENST00000585667 870 ntTSL 524.55■■□□□ 1.528e-7■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 CFAP97-202ENST00000458385 4852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.582e-11■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 PPP1R10-206ENST00000484449 605 ntTSL 54.55□□□□□ -1.682e-11■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 ENPP3-207ENST00000494023 632 ntTSL 34.41□□□□□ -1.72e-11■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 PPP1R10-204ENST00000473954 470 ntTSL 34.06□□□□□ -1.762e-11■■■■■ 29.2
SF3B1O75533 AARSD1-208ENST00000478040 561 ntTSL 29.62□□□□□ -0.871e-8■■■■■ 29.1
SF3B1O75533 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 29.1
SF3B1O75533 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.066e-8■■■■■ 29.1
SF3B1O75533 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.066e-8■■■■■ 29.1
SF3B1O75533 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.976e-8■■■■■ 29.1
SF3B1O75533 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.56e-8■■■■■ 29.1
SF3B1O75533 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.496e-8■■■■■ 29.1
SF3B1O75533 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.466e-8■■■■■ 29.1
SF3B1O75533 MAZ-213ENST00000568411 599 ntTSL 317.09■□□□□ 0.336e-8■■■■■ 29.1
SF3B1O75533 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 29
SF3B1O75533 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 29
SF3B1O75533 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 29
SF3B1O75533 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 29
SF3B1O75533 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 29
SF3B1O75533 SRRM2-212ENST00000572952 1118 ntTSL 214.64□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 29
SF3B1O75533 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.174e-6■■■■■ 29
SF3B1O75533 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC8.66□□□□□ -1.024e-6■■■■■ 29
SF3B1O75533 ARFGAP1-215ENST00000522403 995 ntTSL 517.49■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 29
SF3B1O75533 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 MSH5-206ENST00000423982 2706 ntTSL 514.73□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-8■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 MSH5-SAPCD1-207ENST00000493662 3991 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.681e-8■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 MSH5-211ENST00000463144 2296 ntTSL 510.49□□□□□ -0.731e-8■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 H3F3B-203ENST00000586518 1701 nt30.89■■■□□ 2.544e-7■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 H3F3B-202ENST00000586270 468 ntTSL 226.99■■□□□ 1.914e-7■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 H3F3B-209ENST00000589949 842 ntTSL 219.83■□□□□ 0.774e-7■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 H3F3B-207ENST00000589417 575 ntTSL 219.15■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 H3F3B-205ENST00000587171 586 ntTSL 214.48□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 H3F3B-213ENST00000593254 894 ntTSL 514.48□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 H3F3B-212ENST00000592643 795 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 H3F3B-210ENST00000591890 783 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 H3F3B-204ENST00000586607 551 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 DAZAP1-207ENST00000589484 3414 ntTSL 212.89□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.253e-6■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 RPL13-210ENST00000562879 958 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 28.9
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