Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
LRRC42Q9Y546 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms