Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms