Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP3Q9Y3E7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms