Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVW-1Q9UQF0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms