Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9BQ9UPX0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms