Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms