Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms