Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FZD1Q9UP38 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms