Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms