Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms