Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms