Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms