Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFF4Q9UHB7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms