Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18L2Q9UHA2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SS18L2Q9UHA2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SS18L2Q9UHA2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SS18L2Q9UHA2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SS18L2Q9UHA2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SS18L2Q9UHA2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SS18L2Q9UHA2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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