Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
VTI1BQ9UEU0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VTI1BQ9UEU0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms