Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB4Q9UDY4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB4Q9UDY4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB4Q9UDY4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB4Q9UDY4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB4Q9UDY4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB4Q9UDY4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB4Q9UDY4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB4Q9UDY4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB4Q9UDY4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms