Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4Q9UBX2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4Q9UBX2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms