Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms