Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHPF2Q9P2E5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms