Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP1Q9P0U3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms