Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms