Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP5Q9NZZ3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms